艾美耳球虫可寄生于兔的小肠和胆管，引发兔子感染。

根据球虫寄生部位的不同可分为肠型、肝型和混合型三种，病初，病兔食欲减退，精神沉郁，伏卧不动，生长停滞。眼鼻分泌物增多，体温升高，腹部胀大，臌气，下痢，肛门沾污，排粪频繁。换肠球虫的兔子有顽固性下痢，甚至拉血痢，或便秘与腹泻交替发生。肝球虫病则肝脏肿大，肿区触诊疼痛，黏膜黄染。家兔球虫病的后期往往出现神经症状，如四肢痉挛、麻痹，也会因极度衰竭而死亡。

根据流行病学、临床症状和病理变化可做出初步诊断，确诊需进一步做实验室诊断。

可采取注射，将针剂球虫药注射到兔子皮下，也可直接让兔子口服水剂球虫药。